Es presidida por un Secretario General asistido por un Secretariado General.
La Sede de la CICE se establece en la ciudad donde reside el Secretario General (actualmente está en Roma, Italia).
El Consejo Mundial es el poder soberano de la Conferencia. Reúne cada tres años a los responsables de las Asociaciones y Consejos miembros de la Conferencia.
El Comité Permanente instrumenta las decisiones del Consejo Mundial. Se reúne cada año con los miembros del Secretariado General y los Representantes de las Regiones.
Las Regiones gozan de una amplia autonomía y actúan según sus propios programas.

El Capellán

El Capellán o Asistente Eclesiástico Mundial y sus eventuales adjuntos, son miembros del Consejo Mundial, del Comité Permanente y del Secretariado General.
Su designación se lleva a cabo según el protocolo establecido entre CICE y la Santa Sede.
Colabora estrechamente con el Secretariado General en la representación y aplicación de las políticas de la Conferencia.
Es el nexo entre CICE y la Iglesia.
Designa a los Asistentes Eclesiásticos Regionales y los apoya en su tarea.

Estructura actual:

Secretario General: Dr. Baldur Hermans

Secretarios General Adjuntos: Rodolphe Jabbour, Álvaro Soares

Capellán Mundial: Rev. Monseñor Robert E. Guglielmone

Secretario Regional CICE América: Rolando Rocha M.

Capellán Regional CICE América: Rev. Leo Leblanc

Tesorero Regional CICE América: Mario Lino